Studio delle interazioni covalenti e non covalenti ligando-macromolecola mediante spettrometria di massa

Quest’area di ricerca riguarda l’identificazione e caratterizzazione di ligandi (covalenti e non) di macromolecole, in particolare proteine e acidi nucleici, mediante approcci diversificati di proteomica e spettrometria di massa, inclusa la spettrometria di massa ad alta risoluzione (HMRS) in modalità intact protein analysis (approccio top-down) e shotgun proteomics (approccio bottom-up). La tecnologia è stata applicata in questi ultimi anni non solo per la ricerca di nuovi ligandi (covalenti e non-covalenti) ma anche per lo studio del meccanismo di aptenazione delle proteine.

Pubblicazioni

• Baron G., Borella S., Della Vedova L., Vittorio S., Vistoli G., Carini M., Aldini G., Altomare A. An integrated metabolomic and proteomic approach for the identification of covalent inhibitors of the main protease (Mpro) of SARS-COV-2 from crude natural extracts. Talanta. 2023 Jan 15;252:123824. doi: 10.1016/j.talanta.2022.123824.
• González-Morena J.M., Sánchez-Gómez F.J., Vida Y., Pérez-Inestrosa E., Salas M., Montañez M., Altomare A., Aldini G, Pajares M.A., Pérez-Sala D. Amoxicillin Haptenation of α-Enolase is Modulated by Active Site Occupancy and Acetylation. Front Pharmacol. 2022 Jan 13:12:807742. doi: 10.3389/fphar.2021.807742.
• Garzon D., Ariza A., Regazzoni L., Clerici R., Altomare A., Sirtori F.R., Carini M., Torres M.J., Perez-Sala D., Aldini G. Mass spectrometric strategies for the identification and characterization of human serum albumin covalently adducted by amoxicillin: ex vivo studies. Chem Res Toxicol. 2014 Sep 15;27(9):1566-74. doi: 10.1021/tx500210e.